Reservatet ligger i botten och längs med de västra sluttningarna av Ockrandalgången, vars nutida topografi skapades vid avsmältningen av inlandsisen för ca 10 000 år sedan. De kalkinblandade avlagringar detta vattenflöde avsatte uppvisar egendomliga dräneringsmönster idag med ömsom ytliga vattenflöden och ömsom underjordiska. Ytterst är det detta som ligger till grund för den mångfald av miljöer och arter vi idag finner i området.
Jutjärn i sig är en ca 2 ha stor tjärn med ett djup på blott någon meter. Den har inget synligt tillflöde från norr, utan är grundvattenmatad från ett underjordiskt tillflöde från öster. Det inströmmande vattnet är mättat på kalk vilket fälls ut på tjärnens botten som ett vitt pulver, s.k. kalkbleke. Kalkblekevatten är ovanliga såväl nationellt som internationellt och har därför ett skyddsvärde. Det höga pH värde kalkmättnaden medför, skapar en livsmiljö som endast få organismer kan hantera. Vegetationen i sjön är därför sparsam med gäddnate och hästsvans som dominerande arter.

Markerna som omger tjärnen är desto rikare, längs stränderna finns bl.a. en av länets största ansamlingar av kalkgynnade starrarter. I söder avvattnas tjärnen via Jutjärnsbäcken och i den sumpiga granskogen längs dess sidor har ett flertal rödlistade lavar dokumenterats. Efter 800 meter rinner Jutjärnsbäcken genom en flack sänka i terrängen, där en tät sumpskog av gråal växer. Socklarna till dessa träd är ett eldorado för mossor och lavar.
Från kalkbrottet i nordväst, och genom reservatets västra delar, rinner Lenåsbäcken genom ett i huvudsak underjordisk flöde. Detta präglar markytans vegetation och ger den inslag av gräs och örter. Vid den s.k. Jutjärnsängen är detta som mest utpräglat och här finns en rik ängsflora, bl.a. med ovanliga arter som månlåsbräken, fältgentiana och smällvedel. På ängen hittas också ovanliga fjärilar som guldfransmott och violett guldvinge.
Den skog som reservatet hyser har överlag inte så hög ålder och är också till stor del ganska påverkad av skogsbruksåtgärder i modern tid. Dock finns bestånd med tall av mycket hög ålder och andra kvaliteter. I hela reservatet har ett 40-tal rödlistade arter hittats.

Länsstyrelsen i Dalarnas län

Ia, Strikt naturreservat (Strict Nature Reserve)

50,41

1,93

54,83

56,79