Stabbyskogens naturreservat består av två delområden; Stabby backe och Storbacken. Det ligger cirka 1,5 km väster om Uppsala centrum på båda sidor om Bärbyleden (väg 55). En gång- och cykelbana under vägen förbinder de två delområdena.

Det östra delområdet, Stabby backe, består av ett större sammanhängande naturområde, vilket gränsar till Rickomberga i söder och Luthagen i öster. Norr om Stabby backe ligger Stabby prästgård. Området väster om Stabby backe brukas som åkermark. Stabby backe består av både skogsklädda kullar och öppna gräsmarker som betas av får. Det västra delområdet kallas för Storbacken och utgörs av en serie åkerholmar strax öster om Berthåga kyrkogård. Åkerholmarna utgörs av igenväxande betesmark och skogsklädda bergiga kullar.

Området kring Stabby har varit bebott i flera tusen år. Det finns gott om fornlämningar och flera gravfält från järnåldern. Stabby by har anor från medeltiden. Sedan 1600-talet har backarna betats eller använts för ängsbruk, och flacka partier har brukats som åker. Den historiska markanvändningen har givit upphov till de varierade naturmiljöer som vi ser idag. Naturreservatet har särskilda naturvärden knutna till gamla tallar och till artrika torrbackar med många blommande växter. Upplands landskapsinsekt, den starkt hotade skalbaggen cinnoberbagge, finns också i både Stabby backe och i Storbacken.

Stabby backe är ett mycket populärt friluftsområde och ett av västra Uppsalas viktigaste grönområden. Linnéstigarna Husbyvandringen och Hågavandringen passerar igenom eller i direkt anslutning till området.